《天国书》由使徒约沙书写，约沙在晚年获得了启示。他通过回忆过去跟随逻格伊安的经历得到了启示，预知了主会多次降临世间，每一次降临都将进一步推进天国的到来。他还预言了天国到来的时间，大约是在101个循环之后，也就是启元1111年。

在圣神教3个世纪的发展过程中，涌现了一些伟大的思想家。其中最著名的是奥赫里德的克莱修斯，卢什科察的格拉提安与焚基人诺斯提克（明明是个焚基人却和达洛众神中的奇迹与火焰之神同名）。

克莱修斯驳斥了教会中关于逻格伊安肉身并不存在的观点，否认他是一位天神，和人世间的生活没有任何联系。反对将逻格伊安看成圣神在世间的一个虚假的投影，强调逻格伊安确确实实的以肉身降临到世界上，并且同信徒们同吃同住，最后在莫尔戈斯的迫害和撒脱硫人的逼迫下受刑。克莱修斯在强调逻格伊安的真实性的同时，还重视他的身上的神性。克莱修斯认为逻格伊安是超越时间的永恒存在，超脱一切痛苦，但为我们感受痛苦。克莱修斯为教会的统一做出了巨大贡献，并认为主教是教会领导人。

格拉提安试图将圣神教的思想同克伦尼思想联系起来，他认为古代克伦尼人对达洛众神的崇拜源自对圣神的错误认知。克伦尼人并未能亲眼看见圣神本身，因此他们不能完全领会圣神的旨意，致使崇拜的达洛众神身上都带有人类堕落的罪，所以他们的世界最终陷入战乱和祸端。后来圣神化成肉身降临到世间，于是信徒就能完全的认识圣神。克伦尼人只看到了局部，而逻格伊安的信徒则看到了整体。逻格伊安的信徒才能引导世人走向光辉的未来，创造一个没有罪孽的国度。

焚基人诺斯提克反对圣神创世说，在他眼中世界不是秩序而规律的反而是混乱而邪恶的。圣神只创造了完美的精神，圣神下属的各个小神创造了物质世界。人的精神被囚禁在这个混乱而邪恶的物质世界，逻格伊安是为了将人的精神从堕落的人体中拯救出来。因此逻格伊安的身体不可能是真正的肉体，而是肉体的形象。他的死和受难都不可能是真实的，因为至高的圣神绝不会屈从于邪恶的物质。诺斯提克的学说在教会内部引起轩然大波，最终被驳斥为异端，遭到封锁。尽管如此他的看法还是激发了后来无数学者对逻格伊安与世人关系的思考。

这一时期圣神教的仪式只有两个，洗礼和圣餐。洗礼，将人浸入到圣水之中，赦免人的罪孽，让人得以重生。进行洗礼的人要经过三年的学道训练，受洗前的几个星期训练会进一步加强，包括禁食、自省、弃绝魔鬼、背诵信经等等。当进行洗礼时，受洗者必须赤身进入水中，受浸三次，回答三个关于圣神、圣人、圣灵信仰的问题，每浸水一次回答一次。从水中上来后，受洗者穿回衣服并被带到主教面前。主教为他们施行按手抹油，并说：“我奉全能的圣神，圣灵，圣人的名，用圣油膏抹你。”圣餐通常在周日举行，每年至少进行一次，由教会的主教主持。主教像逻格伊安那样将圣水汇入面中，做成饼分给众人。众人吃下这饼，圣神的灵就与众人同在。为防止饥饿的民众抢食，举行圣餐的场所只有一张桌子，桌子上放着饼，饼由主教。圣餐仪式的流程如下，主教朗诵《圣人书》或是《传道书》，主教讲道，会众站立祷告，问安，主教向圣神，圣灵，圣人诵感恩祷文，会众同应，主教发放饼，主教收集献金保存用作救济穷人。