光熹元年（189年），大将军何进想要诛除宦官，但告诉何太后时，何太后明确反对，称："中官统领禁省，自古及今，汉家故事，不可废也。且先帝新弃天下，我奈何楚楚与士人对共事乎？"

何太后的母亲舞阳君与弟弟何苗等接受宦官的贿赂，多次在何太后面前替宦官求情，并指责何进“专杀左右，擅权以弱社稷”，于是何太后也开始怀疑何进，何进也畏惧宦官积威，导致“事久不决”。

学者认为，何太后之所以坚定地拒绝把宦官作为牺牲品，就她而言，不是利他主义，而是她希望保持与皇帝完全一样的政治自由，这样做是冷酷的需要。何太后要的还不只是政治的自由，还有政治权力。

何进又按袁绍的计策，召四方猛将豪杰进京，要求诛杀宦官，给太后施压，但太后仍然不从。等到董卓逼进京城，何太后才害怕，不得已遣散中常侍小黄门，只留下与何进关系好的宦官守备宫中。

何太后的妹妹是宦官张让的儿媳，张让通过儿媳说情，太后被感动，又召还诸常侍。

八月，何进进入长乐宫，请求何太后诛杀宦官，张让严阵以待，并派人窃听谈话，等何进出宫后，又矫太后诏，令何进再次入宫，并杀之于嘉德殿。

何进部将吴匡、张璋听说何进被杀，与袁绍之弟袁术率军入南宫，张让、段珪等宦官挟持何太后、刘辩、刘协从复道逃到北宫，尚书卢植执戈于阁道窗下责骂段珪，段珪等恐怕，就放开何太后，何太后从阁道跳下，得以逃脱。

并州牧董卓受到征召，领兵马进入洛阳，对朝廷欺凌暴虐，于是胁迫何太后废黜刘辩为弘农王，拥立刘协为帝，是为汉献帝。刘辩被搀扶下殿，北面称臣。何氏哽咽流泪，大臣们含悲忍痛，没有人敢说话。董卓又议何氏逼迫董太后，致使她忧郁而死，违背儿媳妇侍奉婆婆之礼，于是将何氏迁到永安宫。同年九月初三日，董卓派人用毒酒毒死何氏。董卓又让汉献帝到奉常亭为何氏举哀治丧，公卿百官都身着白衣来参加葬礼，不合乎作为太后治丧的礼仪。何氏死后，与汉灵帝合葬在文昭陵。

轶事典故

何氏被立为皇后之际，按规定要谒见二祖（太祖、世祖）庙，但在谒见前斋戒之际，就发生变故，如此反复数次，最终决定不行庙见之礼。时人觉得很奇怪，后来汉朝社稷果然因何氏而倾覆。

历史评价

董卓：太后逼迫永乐太后，令以忧死，逆妇姑之礼，无孝顺之节。

范晔：性强忌，后宫莫不震慑。

丁耀亢：汉之微也，实由何进。何后之立，天正以危汉室也。荼毒弑母，当其收协之时已不两立矣，卒之。何后虽诛，汉室亦微，虽诛百何进，何益哉！后生屠家，故母仪不可不慎也。