新历2060年，被OEP感染9年的女王身，体已经一年不如一年，现在女王的身体相当于奇迹之年前0岁的老人了，那时的人均寿命也只有110多一点。为了寻找治疗的方法，露娜公主穿过巨型星门，来到了地球联邦的领地。同行的除了作为科考船的黑百合，还有第三舰队的方舟级旗舰蓝玫瑰号和第三舰队留在王都的支战列舰舰队，护卫舰120艘。近卫军团月神舰队的72艘护卫舰和400多名骑士也都停泊在蓝玫瑰上。这是此时公主身边能调集的所有战力，要穿越大型星门，再多的战力也不会显得多余，因为将要面对的不再是人类统治的世界。
蓝玫瑰号作为第三舰队的旗舰，是新历1994年刚建成的新型战舰。随行的所有战舰都停泊在蓝玫瑰上，空间依旧十分充足。为了这次航行，公主做了将近一年的准备。这艘500公里长的战舰又回到建造她的空港，在原有的导弹发射仓和近防机炮上都添置了能量武器。甲板上更是竖起三座透明质地的高塔，这是帝国最新式的能量武器系统——星辰。在塔尖汇聚的能量不再需要炮管进行指向引导，可以攻击任意方向的敌人。没有了枪膛的束缚，它们也可以聚集更强大的能量。
这些能量型武器的增加，也完全修改了蓝玫瑰的内部设计，她可能是人类史上搭载反应炉最多的战舰，一共安装了12组反应炉阵列。新型的反应炉阵列，使用的是和蜂鸟那种武器相同的核心，也就是之前巴斯使用的六边形武器当中的填充物，但它并没有沿用之前的结构。为了节约空间，新式的反应炉阵列采用了三维密堆法，反应炉只有拳头大小，大斜方截半立方体的造型。它和卦镜状的柱体，所构成的保护层与投料口形成紧密的堆积。单个阵列有就有100万1024*1024台反应炉，卦镜的柱状隔离层也有300万块，它只有200多米长。这个两百米长的立方体被蔚蓝的能量立场包围，悬浮在其中。最外层的立方体不断喷射能量，让它在立场中不安分的震动。散射的能量立刻就被外部的立场捕获，经过转化以后为战舰提供能源。12个这样的反应炉阵列安装在一个个独立的动力室，分散布置在战舰上。虽然单独阵列没有占据多少空间，但它的附属设备，依然需要近千平米的动力室来存放。
方舟级战舰曾经也有恒星级战舰的称呼，因为它们反应炉所供应的能量，是人类当时能达到的极限，但距离真正的恒星还是有遥远的距离。蓝玫瑰真正实现了恒星级，她的总输出功率已经可以达到最低阶恒星红矮星的水平。帝国有个一直在进行的科研项目，就是恒星引擎计划，它是试图点燃拘束好的气体星球制造恒星，也在试图直接俘获恒星。这个大胆的项目虽然没有成功，但是它的研究成果，为改进蓝玫瑰的动力系统作出了巨大的贡献。原来千台反应炉组合就是阵列式反应炉的极限，现在的蓝玫瑰已经可以达到亿级。在和平年代，这一定是了不起的技术创举，而现在它只是默默的为蓝玫瑰服务。
穿过巨型星门，星图开始矫正空间坐标，周围的一切都浮现在星图上。随着星图全息影像的更新，原本灯火通明的地球，突然暗淡下去，好像时间倒退回洪荒时代。就连原本繁茂的雨林，都褪去原有的绿色，只有几处尚存的聚居区还能看见文明的火种。不远处的月球堡垒还在工作，而露娜却知道，为了重启月球堡垒地面的人类付出了多大的代价。月球堡垒早已在EP的攻击下沦陷，现在运行的堡垒只是依靠还在运行的智能副官。为了重启受EP影响停机的月球堡垒，不但牺牲了无数生命，帝国也出动了方舟战舰紫罗兰，这才顺利重启月球堡垒。现在她接受地面残存的6处聚居区的共同指挥，月球堡垒还负责巨型星门的维护，为了保存这条重要的生命航道。
陷入末日后地球居民的生活也没有什么下滑，只要能活着来到聚居区，物质资源还是相当充沛，帝国舰队经常会投送一些稀缺的物资。最主要的就是限制OEP的内置护盾，还有对付EP的新型武器和拘束装置。但帝国舰队从来没有接近过地球的大气层，因为那将会遭遇和重启月球堡垒一样的损失，地球上的EP就会像闻到味的猫咪，饥饿的EP会吞噬试图经过它们身边的飞船。
地球上的EP无疑是最好的样本，可是所有方舟级战舰都无法在星球表面停泊，失去了蓝玫瑰的能量装甲，即便是精锐的近卫军团，也没有和大群EP叫板的实力。蓝玫瑰只能启动引擎，再去寻找其他合适的目标。露娜选中的目标是星门网络中一个瘫痪的节点，距离地球只有2光年远，没有星门能通过方舟级战舰，到达那里需要两年多的时间。就算使用星门航道，距离那个节点最近的星门也有将近一光年的距离。
这两年亚光速航行的时间也没有浪费，露娜在is系统中继续进行着模拟实验。随行的军官骑士也都是能连接is的精英，他们则在这段时间保持高强度的模拟训练，对战的对象已经不再是人类。是通过生命试验研究所收集的资料，建立的EP模型为训练对象。这里的资料是还在星门网络中的人类共同收集的，里面有黑蔷薇出现的红色鲸鱼，还有各地出现的刚EP化的生物，这种被称为EP的第一型态。它们基本还维持生前生物的样貌，攻击手段也很单一，就是让自己的红色雾气扩散开来，吞噬周围的生命，然后等待这些红色能量回到自己的身体。其中最强的应该就是黑蔷薇出现的红鲸了，因为它在刚EP化时已经吞噬了大量生命能量，而且EP化的本体也是相当庞大的生物，它已经具备了一些第二型态的特征。
第二型态的EP已经可以将雾状的红色能量凝聚成物质，发出可以击穿能量装甲的攻击。它们已经部分失去了固定的形态，由或者就像一团不规则的生物，任何地方都可能发动攻击。发动攻击的部位变成鱿鱼或者乌贼捕食用的触腕，最后还会缠住攻击的目标，直接将猎物拖回自己身边。部分异化的形态还会如长矛手一般，将自己身体固化成尖锐的武器投掷而出。这种攻击方式没有上一种灵活，至少不会改变方向追击目标，但它的穿甲能力更强，可以有效的应对护卫舰的能量装甲。第二型态的EP还会继承一些自己原本的能力，比如帝国遇到的EP化的虎鲸，它就维持了原本生物声呐的功能，在它声呐覆盖的范围内根本无法隐藏，它还能通过声呐捕捉到装甲脆弱的部分进行攻击。帝国在收容它时，付出了惨痛的代价，也收获了这份重要的情报。通过和星门网络中的盟友交换信息，几乎可以确认，所有EP化的生物，都会保留几样原本的能力，其中许多能力都相当棘手。