崇祯十六年十一月，江南巡抚郑瑄听闻准备升任唐晨为兵备副使，被钱谦益干预转升为知府，而他自己的学生黄玉鼎升任兵备副使。黄玉鼎命唐晨平倭，唐晨献上人头，还有那知府的人头和新任知县的人头，黄玉鼎被吓到，知道唐晨是个狠角色，忙听从唐晨建议推荐唐晨师爷做了县令。

崇祯十七年二月，唐晨升任松江知府，师爷周良卿成为上海知县，上海士绅听闻唐晨不但没把罢官，还直接升为知府，十分失望，只能认命。

崇祯十七年二月到五月大练兵马，杀豪绅，坐稳松江，遣人北上献银，得封兵备副使，五月得知京师陷，支持马士英拥立福王，得升应天巡抚，命驻苏州，被张慎言等东林党诬为国贼，率军来攻，唐晨还击，带兵入南京，福王被吓坏，群臣斥之，唐晨回苏州，被升为江南总督。三月，左良玉举兵而来，唐晨自请御敌，怕唐晨再入南京，被拒绝，唐晨只得找史可法，愿意援救史可法，但史可法不信任唐晨，认为唐晨要割扬州自立，拒城不让唐晨进。

适逢徐州失陷，唐晨与扬州城下大战清军，却被史可法袭击，击退史可法，唐晨怒夺扬州。于扬州大战，清军败退，俘郡王。

清军夺滁州南下，唐晨请守南京请统兵守南京，被拒，四月南京陷，五月初八日多铎入南京，福王芜湖被杀，潞王逃杭州，七月抗清军，杀李成栋，十月救杭州，但潞王已降，。十二月救绍兴，欲迎鲁王于苏州，张国维与熊汝霖拒绝，且与清军媾和，意图灭唐晨，唐晨击败清军，杀鲁王，以儆效尤。尊隆武为主，得授大学士，督师东南。

清军避开唐晨，专攻隆武，郑芝龙投降，隆武被灭，唐晨进兵福建，时浙江、南直隶、福建三地俱在唐晨之手。

绍武自立，封唐晨文渊阁大学士，永历自立封唐晨文华殿大学士。绍武被清军灭，唐晨奉永历为主，得升武英殿大学士，国公之爵，唐晨平江西。李定国平广西，南明形势一片大好。但孙可望从中作梗，李定国大败，孙可望投降，李定国退守云南。唐晨无奈退保江西，独自面对洪承畴十万大军，击退洪承畴。

吴三桂南下灭云南，唐晨被封常宁王，打湖广交通线，但依旧未来得及，永历逃入缅甸，此时唐晨早已派军舰于升龙登陆，于缅甸杀退吴三桂，接永历回南京。唐晨得封吴王。让各方议政，制定临时约法。然后北伐。征战天下，一统中原。